декларация по налогу на прибыль
 

как расчитать стр. 040 в приложении 2(косвенные расходы), что именно к ним относится?

Взносы включаются в расходы. НК ст.255 п/п16 "в расходы на оплату труда (помимо зарплаты)включаются взносы на обяз. и добр. страхование ПФ."
Оплата труда может попасть и в стр.010, и в стр.040 прил.№2 к л.02.
В стр. 040 не попадет оплата труда, которая формирует прямые расходы с 20 счета и включается в стр.010 этого приложения.
Счет 69.11, взн. от несч.сл. - это всегда прочие расходы, т.е. строка 040.

к ним относятся принимаемые для целей налогообложения расходы не являющиеся прямыми или внереализационными.