ЗУП
 

Наследники принесли больничные листы умершего сотрудника. Нужно ли платить с них НДФЛ и если не надо то ка это сделать в 1с

не надо
можно скопировать основное начисление с "Оплата больничных листов" как новое начисление, например, "Оплата больничных листов по смерти", НДФЛ не облагается на вкладке Налоги...

ну и в доке БЛ в табличной части после расчёта поменять первое начисление на второе...