Сумированный учёт РВ
 

Можно ли в ЗУП вести суммированный учет рабочего времени в следующем варианте
по вредникам период квартал, а по остальным год

Можно. В ЗУП вообще не реализован подсчет сверхурочных по окончании учётного периода. Как и сам учётный период нигде не устанавливается. А вести учет можно. Вручную. Или с помощью обработок, напр., на инфостарте поискать можно.