Расчеты за аренду с физ лицом из ЗуП 3.1 в БП 3.0
 

Платим за аренду физ лицу.
В БП выписываем акт, в ЗуП вводим документ начисление прочих доходов.
Т.к. в БП введен акт, что бы не формировать проводку 26 60 повторно, выбрано отражение в учете с незаполненными полями.
После выгрузки из ЗиК формируется проводка по начислению НДФЛ 76 68.01.
Скажите пожалуйста, как сделать что бы при начислении НДФЛ формировалась проводка 60 68.01?

Физлицо не организация и не ИП. Зачем расчёты с ним ведёте по 60-му счёту? Ведите по 76-му. ЗУП в связке с БП в принципе не умеет использовать другие счета, кроме 70 и 76 (не считая затратных). И в плане счетов 94н разве есть корреспонденция 60-го с 68-м? 76 счёт как-то ловчее для этого приспособить.

А наш бухгалтер просит настроить "Клмпенсацию АВТО" на 73 - это возможно?

73 по дебету, или по кредиту?

По кредиту.
Обычно, это делают через договор ГПХ.
И ставят способ начисления, не связанный с оплатой труда.